O jogo é ambientado no universo Digimon Data Squad e gira em torno dos sete grandes senhores demoníacos. Neste jogo, o jogador poderá controlar os quatro principais personagens de Savers, Marcus Damon, Thomas H. Norstein, Yoshino "Yoshi" Fujieda e Keenan Crier, juntamente com seus respectivos parceiros da Digimon. Os gráficos para este jogo são sombreados e o sistema de batalha é semelhante ao terminal de batalha (um jogo de arcade apenas japonês). O jogo é classificado como um "gênero especial", chamado de "RPG dramático/inovador", o que significa que os parceiros da Digimon são afetados por como você, o jogador, os trata. A maneira como seu Digimon evolui será semelhante ao mundo Digimon; O Digimon será afetado pela maneira como você cuida dele e, dependendo disso, será digivol em diferentes tipos de Digimon. Em Digimon World Data Squad, um novo tipo de método de digivolução é usado, chamado sistema de evolução da Galactica: isso determinará em que digimon seu parceiro evoluirá. Também haverá caracteres novos e originais para este jogo, o que significa que esses personagens são exclusivos-e não aparecerão em nenhuma outra mídia do Digimon Data Squad.