Esta história é sobre um garoto chamado Tohno Shiki que, depois de sofrer um acidente traumático, acorda no hospital com a capacidade de ver linhas e rachaduras em todas as superfícies e ser. Essas linhas, quando rastreadas com qualquer borda nítida ou franca, serão cortadas permanentemente. Como ele é forçado a ver essas linhas em todos os lugares, Shiki fica perturbado até conhecer uma garota de mago que lhe dá óculos que lhe permitem viver uma vida normal.

Anos depois, depois de morar no lar de um parente, a morte de seu pai o chamou de volta à mansão que ele deixou anos atrás. Lá ele deve aprender a morar com sua irmã mais nova e duas garotas de empregada.

Um dia, a vida de Shiki dá uma guinada para o pior quando, a caminho da escola, ele conhece uma mulher loira e tomou vontade de matá -la.