A jogabilidade de Tomb Raider II baseia-se no jogo original. Inovações incluem novas armas, movimentos extras, um pequeno conjunto de veículos, fases maiores e muitos inimigos. Em termos de movimentos, Lara pode, agora, escalar parede e rolar no ar para o solo na direção oposta que o jogador tenha que enfrentar. As armas foram expandidas para arma de arpões, um lançador de granadas, e um rifle M16.