Daikatana é um jogo de tiro em primeira pessoa que usa o motor Quake II . O jogo é dividido em quatro episódios de vários níveis cada, cada episódio ocorrendo em um período de tempo diferente: Japão do futuro distante, Grécia antiga, Noruega da Idade das Trevas e EUA do futuro próximo. O jogo usa cutscenes e texto para contar a história. Dois personagens controlados por IA acompanham Hiro durante a missão, ajudando-o em batalhas e também exigindo proteção. Além de várias armas de fogo diferentes, o próprio Daikatana, que o jogador adquire no Episódio 2, pode ganhar experiência e ficar mais forte conforme é usado. O jogo inclui um modo deathmatch multijogador.