GoldenEye: Rogue Agent é um jogo de tiro em primeira pessoa, onde o jogador assume o papel de um ex-MI6, o agente Jack Hunter, que é recrutado por Auric Goldfinger, membro de uma poderosa organização criminosa, para assassinar seu rival Julius No. Vários outros personagens da série James Bond fazem aparições ao longo do jogo. Apesar de fazer parte do universo de James Bond, o jogo não tem relação com o filme de 1995 ou o jogo de 1997 de mesmo nome. Neste cenário, o protagonista recebe o nome de GoldenEye depois que ele perde seu olho e recebe um olho cibernético de cor dourada para a substituição do olho perdido.