A favela ... uma área da cidade completamente esquecida. Ninguém poderia imaginar a crueldade sofrida por pessoas inocentes que foram transformadas em criaturas mutantes horríveis por experimentos genéticos. Eles pairavam em todos os lugares e assumiram completamente o controle da cidade.

Mutation Nation é um jogo de ação de 1-2 jogador, onde você deve controlar seu herói e espancar qualquer mutante que atravessa o seu caminho, usando os punhos ou um dos quatro ataques especiais. Um chefe no final de cada área precisa ser derrotado se você quiser prosseguir com o jogo.