Esta versão é um jogo de plataforma side-scrolling . A versão Sega CD apresenta jogabilidade idêntica às versões Genesis e SNES. A versão Game Gear tem oito níveis e a versão Genesis apresenta 11 níveis, enquanto as versões SNES e Sega CD têm 12 níveis. Cada versão apresenta vários locais que incluem cavernas, florestas, lagoas e montanhas nevadas. Ao longo do jogo, o jogador deve se defender contra os capangas piratas de Hook (Capitão Gancho), bem como aranhas, cobras e esqueletos. A principal arma de Peter Pan é um punhal . Após completar o primeiro nível, o jogador recebe a espada dourada como arma, capaz de disparar bolas de energia. Se o jogador for atacado, Peter Pan larga a espada e deve usar a adaga, enquanto a espada de ouro às vezes pode ser recuperada no nível seguinte.
O medidor de saúde do jogador é medido como folhas. O jogador começa com duas folhas e perde uma cada vez que um inimigo ataca. O jogador pode coletar folhas adicionais ao longo do jogo para aumentar o medidor de saúde, para um total máximo de quatro folhas. Frutas espalhadas por cada nível podem ser coletadas para reabastecer o medidor de saúde do jogador. Depois de coletar pó mágico, Peter Pan tem a capacidade de voar por curtos períodos de tempo, até que o medidor de voo fique vazio. Sininho aparece ao longo do jogo para reabastecer a barra de voo.