Ben 10: Protector of Earth leva o herói de dez anos de idade, Ben Tennyson, pela primeira vez aos videogames. Ben é um garoto com um dispositivo chamado Omnitrix, que o permite que ele se transforme em diferentes seres do espaço, cada um com poderes e habilidades únicos mas mantenha a mesma personalidade. Os poderes do Omnitrix são utilizados para combater um entre cinco monstros alienígenas, em uma aventura que dá ao jogador a nobre missão de salvar o mundo.